中文字幕在线中乱码,青青青国产最新视频在线观看,无遮挡免费一级毛片视频,激情国产原创在线观看

 
 

高性能計算之源起——科學(xué)計算的應(yīng)用現(xiàn)狀及發(fā)展思考

發(fā)布時間:2019-07-12 10:17:55  |  來源:中國網(wǎng)·中國發(fā)展門戶網(wǎng)  |  作者:金鐘 陸忠華 李會元等  |  責(zé)任編輯:趙斌宇
關(guān)鍵詞:科學(xué)計算,高性能計算機(jī),高性能計算應(yīng)用

計算材料學(xué)之材料結(jié)構(gòu)預(yù)測

現(xiàn)狀

材料是國民經(jīng)濟(jì)的基石,是實現(xiàn)制造業(yè)轉(zhuǎn)型升級的重要基礎(chǔ)。隨著計算機(jī)模擬技術(shù)的發(fā)展,流體力學(xué)、材料和醫(yī)療等專業(yè)領(lǐng)域也開始使用模型輔助科學(xué)研究。由于其問題的復(fù)雜性,這些領(lǐng)域的模型參數(shù)優(yōu)化使用單一的優(yōu)化算法或者適應(yīng)度計算方法無法有效解決問題,比如某些方法精度高但運(yùn)行時間長,而某些方法需要苛刻的前置條件。因此,在這些領(lǐng)域通常采用多種方法結(jié)合的方式進(jìn)行參數(shù)優(yōu)化,即由不同步驟組合起來進(jìn)行問題求解,從而發(fā)揮各個方法的優(yōu)點,更有效率的解決問題。同時,應(yīng)用領(lǐng)域有很多商業(yè)軟件,不提供相應(yīng)SDK(軟件開發(fā)工具包),整個流程通常只能采用腳本語言(如Shell語言)對各個步驟進(jìn)行連接。

對領(lǐng)域應(yīng)用的促進(jìn)

多步驟參數(shù)優(yōu)化算法的典型場景是材料學(xué)領(lǐng)域的晶體結(jié)構(gòu)預(yù)測算法。目前常見的結(jié)構(gòu)能量計算方法有分子動力學(xué)模擬的方法和基于第一性原理的密度泛函理論(DFT)方法。DFT方法能夠提供更準(zhǔn)確的結(jié)構(gòu)能量,但計算成本很高。以TiO2晶體為例,采用分子動力學(xué)軟件LAMMPS計算其能量,平均耗時為169 ms(100次實驗的統(tǒng)計結(jié)果,下同);而采用DFT軟件VASP計算其能量,平均耗時為10 309.27 s,兩者相差將近6萬倍。在DFT軟件的基礎(chǔ)上采用參數(shù)優(yōu)化算法搜索結(jié)構(gòu)晶體狀態(tài),其時間成本很可能超出科學(xué)家可接受時間上限。由此可見,單純采用分子動力學(xué)方法進(jìn)行結(jié)構(gòu)能量模擬,很難獲得和DFT方法同等的模擬精度;而單純采用DFT方法,隨著分子結(jié)構(gòu)復(fù)雜度上升,其時間成本越來越昂貴。

發(fā)展趨勢

多步驟參數(shù)優(yōu)化算法較好地解決了這個問題。目前該領(lǐng)域通常是將兩種方法結(jié)合,在不明顯影響系統(tǒng)效率的情況下,有效提升模擬方法的精確度。美國Ames國家實驗室提出一種AGA(Adaptive Genetic Algorithm)算法,其采用遺傳算法進(jìn)行給定結(jié)構(gòu)的晶體狀態(tài)搜索,在GA計算個體適應(yīng)度時,采用分子動力學(xué)方法模擬結(jié)構(gòu)能量。同時,創(chuàng)造性地添加了Adaptive loop模塊,將GA生成的數(shù)個最優(yōu)結(jié)構(gòu)交與第一性原理DFT方法重新精確計算其結(jié)構(gòu)能量,再采用Force-Matching方法基于精確信息對分子動力學(xué)方法的勢參數(shù)進(jìn)行耦合,從而提升分子動力學(xué)方法的精確性。如此組成大循環(huán),直至收斂。

<  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11  12  >  


返回頂部