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2011年08月11日17:25 | 中國發展門戶網 www.chinagate.cn | 給編輯寫信 字號：T|T

　　中國發展門戶網8月11日電 日前，中國科學院編寫了《中國科學院信息化發展報告2011》，在其中介紹了中科院超算環境特點及成效。具體內容如下：

　　1.引領國內大規模科學計算應用

　　從中國國家網格各節點及應用來看，中科院超算總中心作為國家網格的主節點，截至2009年，成功運行的千核應用有8個。

應用名稱	運行核數
星系演化大規模并行程序P_widgeon	8,192
結合精確相互作用勢模型以及新型構象取樣技術的蛋白質折疊過程模擬	6,400
鳳凰計劃	1,024
復雜生物分子模擬和藥物虛擬篩選	4,096
流感病毒血凝素蛋白受低pH調控的計算模擬研究	1,024
盤古計劃：解析暗宇宙中的結構形成	2,048
基于圖形處理器的復雜油氣儲層介質中聲場的多尺度離散模擬計算研究	1,024
基于分子模擬的中藥有效成分作用的生物系統網絡構建	7,200

圖表 19.千核應用規模

　　此外，中國國家網格運行管理中心發布的各節點單位應用及部署情況也表明，在國家網格應用的部署、移植等方面，院超級計算中心的網格應用在中國國家網格各個計算節點中也居于領先地位。

　　2.服務社會創新活動初見成效

　　中科院不斷探索科研信息化基礎設施的共建、共享、共用的建設與服務新模式，推進與北京、武漢、深圳等地合作，積極為地方經濟社會發展服務，已累計為社會提供機時服務超過950萬CPU小時（至2010年6月底），涉及化工、冶金、醫藥、汽車設計、安全等多個領域。

　　2009年，院超級計算中心成為了首都科技條件平臺研發服務實驗基地。截至2009年12月底，院超級計算中心服務于北京市及駐京各類企事業、科研高校，如中國中醫科學院中醫藥信息研究所、北京生命科學研究所、清華大學、北京航空航天大學等共計12個案例，取得了較好的社會效益和一定的經濟效益。

　　院超級計算中心的科研人員為中醫研究所開發了并行化中藥方劑配伍程序，基于中醫科學院提供的中藥方劑配伍模型，運用高性能計算手段，針對中醫處方數據統計不同藥劑的配伍情況，加速了配伍計算過程，為研究分析中醫處方的成分、劑量及藥效提供科學性統計分析依據。

　　院超級計算中心利用深騰7000超級計算機，為北京生命科學研究所所做的流感病毒膜蛋白—血凝素（HA）構象變化的分子動力學模擬提供了千核以上模擬計算的基本條件，為研究流感病毒入侵細胞過程中的分子機制以及新型廣譜抗流感藥物的設計與開發提供了重要的支撐。

　　院超級計算中心目前正積極組織人力針對美國財富500強企業SMITH INTERNATIONAL, INC.下屬的史密斯鉆井設備（常州）有限公司北京第二分公司的核心知識產權—勘探模擬軟件進行改進，幫助其找到適合該軟件的硬件平臺，制定軟件改進方案，其中包括改進并行算法、并行實現方法優化（通信優化）、代碼優化（提高CACHE命中率）等多個方面，并正在籌劃進一步合作洽談。

　　此外，院超級計算中心正在積極努力為北京長城華冠汽車技術開發有限公司提供穩定、高效、安全的高性能計算服務，計劃通過與CAE軟件結合、以工作流方式，為華冠汽車提供軟、硬件平臺的一攬子服務解決方案。

　　3.超算應用服務專業化初步顯現

　　經過多年的積累，并依托超級計算中心的超級計算機、院超級計算環境，我們已可為用戶提供及時、高效、準確的計算機時服務；為化學、生物學、大氣科學、地學、天體物理、可視化和工業計算等學科領域提供服務的專業化技術團隊已初具規模。通過建立VIP用戶服務機制，實現了服務的標準化、規范化和價格體系化，向打造超級計算機時服務的專業化品牌而努力。

　　在一年一度的高性能計算培訓的基礎之上，廣泛開展了計算化學、生物信息等學科的軟件使用培訓服務，通過“請進來，走出去”的方式，為廣大院內外的科研人員提供高性能計算、學科軟件應用的按需培訓服務，截至2010年10月底，在北京、昆明、蘭州、大連等地共舉辦高性能計算、GPU、計算化學、生物信息等專場培訓近20次，培訓學員超過3,000人次，覆蓋院內外單位超過100家，有力地促進了中科院及院外各高性能計算應用領域科研活動的廣泛開展。

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